De 1975 a 1981
ensinou no Herman-Zilcher-Konservatorium da cidade de Würzburg, instituto cuja
direcção assumiu em 1978.
Desde 1982, Gerhard Doderer lecciona
na Universidade Nova de Lisboa onde é Professor Catedrático do Departamento de Ciências
Musicais.
As suas numerosas
publicações (algumas delas contempladas com prémios do Conselho Nacional da Música da
Fundação Calouste Gulbenkian e da Academia Portuguesa de História), os seus recitais de
órgão e os cursos e seminários no âmbito das Ciências Musicais que tem vindo a
realizar, tanto em países europeus como extra-europeus, têm, de um modo especial,
incidido sobre instrumentos e compositores dos séculos XVI, XVII e XVIII.
Gravou vários discos com
música Ibérica em órgãos históricos portugueses.
É membro do grupo de apoio
científico criado pelo IPPAR para acompanhar o restauro dos órgãos da Basílica de
Mafra.